MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 chromosome

Total Repeats: 88507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008255	TGA	2	6	199	204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636428
2	NC_008255	GAA	2	6	221	226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636428
3	NC_008255	A	6	6	251	256	100 %	0 %	0 %	0 %	110636428
4	NC_008255	A	7	7	266	272	100 %	0 %	0 %	0 %	110636428
5	NC_008255	ACC	2	6	278	283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110636428
6	NC_008255	CAT	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636428
7	NC_008255	T	7	7	301	307	0 %	100 %	0 %	0 %	110636428
8	NC_008255	GAAA	2	8	316	323	75 %	0 %	25 %	0 %	110636428
9	NC_008255	GCA	2	6	395	400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636428
10	NC_008255	ATT	2	6	405	410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636428
11	NC_008255	GCT	2	6	451	456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636428
12	NC_008255	CTT	2	6	489	494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636428
13	NC_008255	TCA	2	6	517	522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636428
14	NC_008255	T	7	7	528	534	0 %	100 %	0 %	0 %	110636428
15	NC_008255	TA	3	6	551	556	50 %	50 %	0 %	0 %	110636428
16	NC_008255	GATG	2	8	628	635	25 %	25 %	50 %	0 %	110636428
17	NC_008255	AAC	2	6	716	721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636428
18	NC_008255	TTG	2	6	732	737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636428
19	NC_008255	TAT	2	6	797	802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636428
20	NC_008255	TG	4	8	1046	1053	0 %	50 %	50 %	0 %	110636429
21	NC_008255	CGG	2	6	1061	1066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110636429
22	NC_008255	A	8	8	1087	1094	100 %	0 %	0 %	0 %	110636429
23	NC_008255	TGT	2	6	1134	1139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636429
24	NC_008255	A	8	8	1164	1171	100 %	0 %	0 %	0 %	110636429
25	NC_008255	GAA	2	6	1202	1207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636429
26	NC_008255	A	7	7	1232	1238	100 %	0 %	0 %	0 %	110636429
27	NC_008255	GAA	2	6	1246	1251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636429
28	NC_008255	CTG	2	6	1253	1258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636429
29	NC_008255	GAA	2	6	1318	1323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636429
30	NC_008255	ATT	2	6	1339	1344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636429
31	NC_008255	GTTT	2	8	1394	1401	0 %	75 %	25 %	0 %	110636429
32	NC_008255	ATTTC	2	10	1487	1496	20 %	60 %	0 %	20 %	110636429
33	NC_008255	GCCG	2	8	1506	1513	0 %	0 %	50 %	50 %	110636429
34	NC_008255	GGA	2	6	1534	1539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110636429
35	NC_008255	T	6	6	1558	1563	0 %	100 %	0 %	0 %	110636429
36	NC_008255	TGC	2	6	1580	1585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636429
37	NC_008255	TCC	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110636429
38	NC_008255	TG	3	6	1632	1637	0 %	50 %	50 %	0 %	110636429
39	NC_008255	TTA	2	6	1661	1666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636429
40	NC_008255	TAA	2	6	1682	1687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636429
41	NC_008255	CAA	2	6	1709	1714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636429
42	NC_008255	T	6	6	1808	1813	0 %	100 %	0 %	0 %	110636429
43	NC_008255	GAT	2	6	1982	1987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636430
44	NC_008255	AAG	2	6	2022	2027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636430
45	NC_008255	T	6	6	2039	2044	0 %	100 %	0 %	0 %	110636430
46	NC_008255	CAT	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636430
47	NC_008255	CA	3	6	2106	2111	50 %	0 %	0 %	50 %	110636430
48	NC_008255	AGC	2	6	2133	2138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636430
49	NC_008255	GAA	2	6	2201	2206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636430
50	NC_008255	TGC	2	6	2265	2270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636430
51	NC_008255	CAG	2	6	2288	2293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636430
52	NC_008255	GAT	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636430
53	NC_008255	AATTG	2	10	2311	2320	40 %	40 %	20 %	0 %	110636430
54	NC_008255	GAA	2	6	2405	2410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636430
55	NC_008255	TCAA	2	8	2411	2418	50 %	25 %	0 %	25 %	110636430
56	NC_008255	AGG	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110636430
57	NC_008255	AG	3	6	2509	2514	50 %	0 %	50 %	0 %	110636430
58	NC_008255	CTT	2	6	2521	2526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636430
59	NC_008255	CAAG	2	8	2593	2600	50 %	0 %	25 %	25 %	110636430
60	NC_008255	ACA	2	6	2673	2678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636430
61	NC_008255	TTC	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636430
62	NC_008255	T	6	6	2769	2774	0 %	100 %	0 %	0 %	110636430
63	NC_008255	ACA	2	6	2775	2780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636430
64	NC_008255	CATT	2	8	2923	2930	25 %	50 %	0 %	25 %	110636430
65	NC_008255	CAT	2	6	3013	3018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636430
66	NC_008255	GAA	2	6	3038	3043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636430
67	NC_008255	GTG	2	6	3108	3113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110636430
68	NC_008255	TGA	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636430
69	NC_008255	TAT	2	6	3179	3184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636430
70	NC_008255	CAG	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636430
71	NC_008255	GTT	2	6	3280	3285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636430
72	NC_008255	ATT	2	6	3319	3324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636430
73	NC_008255	AAAT	2	8	3346	3353	75 %	25 %	0 %	0 %	110636430
74	NC_008255	GA	3	6	3390	3395	50 %	0 %	50 %	0 %	110636431
75	NC_008255	AGA	2	6	3461	3466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636431
76	NC_008255	TTGG	2	8	3508	3515	0 %	50 %	50 %	0 %	110636431
77	NC_008255	TA	3	6	3559	3564	50 %	50 %	0 %	0 %	110636431
78	NC_008255	CAG	2	6	3568	3573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636431
79	NC_008255	AGG	2	6	3590	3595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110636431
80	NC_008255	TGA	2	6	3632	3637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636431
81	NC_008255	TAT	2	6	3757	3762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636431
82	NC_008255	A	6	6	3787	3792	100 %	0 %	0 %	0 %	110636431
83	NC_008255	TGA	2	6	3820	3825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636431
84	NC_008255	GTTC	2	8	3912	3919	0 %	50 %	25 %	25 %	110636431
85	NC_008255	TGG	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110636431
86	NC_008255	AGTGC	2	10	3942	3951	20 %	20 %	40 %	20 %	110636431
87	NC_008255	AGAA	2	8	3982	3989	75 %	0 %	25 %	0 %	110636431
88	NC_008255	CAG	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636431
89	NC_008255	T	6	6	3999	4004	0 %	100 %	0 %	0 %	110636431
90	NC_008255	TCA	2	6	4103	4108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636431
91	NC_008255	TGC	2	6	4157	4162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636432
92	NC_008255	TTC	2	6	4282	4287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636432
93	NC_008255	TGC	2	6	4307	4312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636432
94	NC_008255	GCT	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636432
95	NC_008255	AT	3	6	4415	4420	50 %	50 %	0 %	0 %	110636432
96	NC_008255	GGC	2	6	4521	4526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110636432
97	NC_008255	ATT	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636432
98	NC_008255	TACA	2	8	4619	4626	50 %	25 %	0 %	25 %	110636432
99	NC_008255	AGG	2	6	4634	4639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110636432
100	NC_008255	ATT	2	6	4675	4680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636432
101	NC_008255	A	6	6	4703	4708	100 %	0 %	0 %	0 %	110636432
102	NC_008255	GTA	2	6	4758	4763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636432
103	NC_008255	TTC	2	6	4767	4772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636432
104	NC_008255	A	6	6	4779	4784	100 %	0 %	0 %	0 %	110636432
105	NC_008255	GCA	2	6	4785	4790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636432
106	NC_008255	A	7	7	4917	4923	100 %	0 %	0 %	0 %	110636433
107	NC_008255	AGGA	2	8	4946	4953	50 %	0 %	50 %	0 %	110636433
108	NC_008255	AGA	2	6	5064	5069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636433
109	NC_008255	TTCCT	2	10	5075	5084	0 %	60 %	0 %	40 %	110636433
110	NC_008255	TGC	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636433
111	NC_008255	ATT	2	6	5174	5179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636433
112	NC_008255	GAAG	2	8	5214	5221	50 %	0 %	50 %	0 %	110636433
113	NC_008255	CGG	2	6	5250	5255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110636433
114	NC_008255	GAA	2	6	5347	5352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636433
115	NC_008255	TA	3	6	5486	5491	50 %	50 %	0 %	0 %	110636433
116	NC_008255	GAA	2	6	5497	5502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636433
117	NC_008255	A	6	6	5515	5520	100 %	0 %	0 %	0 %	110636433
118	NC_008255	TGA	2	6	5543	5548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636433
119	NC_008255	GCAG	2	8	5571	5578	25 %	0 %	50 %	25 %	110636433
120	NC_008255	A	6	6	5609	5614	100 %	0 %	0 %	0 %	110636433
121	NC_008255	ACC	2	6	5747	5752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110636434
122	NC_008255	CAC	2	6	5782	5787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110636434
123	NC_008255	CAG	2	6	5791	5796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636434
124	NC_008255	AGT	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636434
125	NC_008255	TTTTG	2	10	5810	5819	0 %	80 %	20 %	0 %	110636434
126	NC_008255	CTT	2	6	5821	5826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636434
127	NC_008255	AGT	3	9	5881	5889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636434
128	NC_008255	CCGAAA	2	12	5913	5924	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	110636434
129	NC_008255	TGTC	2	8	5957	5964	0 %	50 %	25 %	25 %	110636434
130	NC_008255	T	6	6	5965	5970	0 %	100 %	0 %	0 %	110636434
131	NC_008255	CAA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636434
132	NC_008255	TAG	2	6	6010	6015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636434
133	NC_008255	CCTGTA	2	12	6069	6080	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110636434
134	NC_008255	AAATC	2	10	6105	6114	60 %	20 %	0 %	20 %	110636434
135	NC_008255	T	7	7	6174	6180	0 %	100 %	0 %	0 %	110636434
136	NC_008255	CAG	2	6	6181	6186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636434
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385	NC_008255	AGG	2	6	18425	18430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110636443
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391	NC_008255	AAGC	2	8	18685	18692	50 %	0 %	25 %	25 %	110636443
392	NC_008255	AAT	2	6	18697	18702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636443
393	NC_008255	TCGT	2	8	18726	18733	0 %	50 %	25 %	25 %	110636444
394	NC_008255	TTA	2	6	18750	18755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636444
395	NC_008255	TAAAT	2	10	18775	18784	60 %	40 %	0 %	0 %	110636444
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398	NC_008255	AAG	2	6	18957	18962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636444
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401	NC_008255	GGC	2	6	19034	19039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110636444
402	NC_008255	CA	3	6	19141	19146	50 %	0 %	0 %	50 %	110636444
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